Fenix 3 HR在Fenix 3蓝宝石版的基础上升级而来，它集成了GARMIN自家的Elevate光学心率计，无需心率带就能实现7x24小时心率监测以及运动中实时心率记录。搭配HRM-RUN心率带使用可以实现第二代动态数据监测，其中包括步幅、垂直步幅比和双脚触地平衡三个全新参数，此外还能给出乳酸阈值和基于HRV心率变异性而估算的紧张指数等指标。

由于内置了光学心率计，所以对续航有着不小的影响，在UltraTrac模式下续航从50小时降为40小时，GPS模式下从20小时降为16小时，手表模式下从6周降为5周，如果开启推送的话续航就只有2周了。如果介意续航的话可以在设置中将心率计关闭。此外Fenix 3 HR国行中文版还采用了DLC类钻碳镀膜技术来增加硬度和耐腐蚀性，在其他国家和地区的版本中都没有DLC加持。